广药集团持有的医药主业资产中，29项商标因“王老吉(微博)”商标法律纠纷问题未纳入拟购买资产范围；广州医药研究总院因现为全民所有制企业，需完成改制后方可转让未纳入拟购买资产范围。

对于未注入资产，广药集团承诺说，待“王老吉”商标法律纠纷解决，可转让之日起两年内，广药集团将按照届时有效的法律法规的规定，将“王老吉”系列商标及广药集团许可王老吉药业一定条件下独家使用的其他4项商标，依法转让给广州药业；待广州医药研究总院完成公司制改建、股权可转让之日起两年内，广药集团将按照届时有效的法律法规的规定，择机依法转让给广州药业。

通过本次重大资产重组，新广州药业作为广药集团医药主业的单一上市平台，将拥有包括医药研发与制造、医药分销与零售在内的完整产业链，形成中药、化学药、生物药、大健康产业、物流业及综合产业六大板块，并将拥有全国领先的制药研发实力以及中成药及中药饮片、化学原料药、化学制剂、生物制品及保健品等在内的门类齐全、数量众多的拳头产品。

根据重组预案，以2011年度财务数据模拟，本次重组完成后，广州药业总资产将由48.51亿元上升至84.31亿元，净资产收益率(摊薄)将由7.60%提升至10.15%，每股收益(摊薄)将由0.3550元提升至0.4353元，上市公司总资产和净资产规模大幅提升，净资产收益率及每股收益均增长，盈利能力显著增强。