为保护海洋生态环境，福建主抓了几方面工作：初步建立海陆统筹海洋环保工作机制，福建省在全国率先下发《关于建立协调工作机制的方案》，推动沿海市、县海洋和环保部门建立相应合作协调机制；持续加强海洋生态建设与修复，先后建立１２个海洋自然保护区、３个海洋生态特别保护区、６个国家级水产种质资源保护区以及１２个县级水生生物保护区，投入３亿多元海域使用金开展了厦门湾、东山湾、泉州湾等一大批海域海岛海岸带整治修复重点项目。

同时，福建落实海洋环保政府目标责任制，下达了《沿海设区市海洋环保责任目标（２０１１－２０１５）》，进行全面量化专项考核。到２０１５年，福建力争海洋生产总值占全省地区生产总值的２８％以上；近岸海域清洁、较清洁水面达６５％以上，基本实现“海洋强省”目标。

去年以来，福建海洋产业发展也亮点突出：海洋生物医药、邮轮游艇、海洋工程装备、海洋可再生能源等海洋新兴产业迅速崛起，２０１２年实现总产值３９１亿元，增长５７．６％，是福建七大战略新兴产业中增长速度最快的行业；海洋产业示范园区规划建设初见成效，全省策划和筛选出２６个园区重点推进。

另外，福建远洋渔业发展实现新跨越，２０１２年全省新增远洋渔业企业９家，增长一倍多；海洋渔业、海洋交通运输、滨海旅游、船舶修造、海洋工程建筑等五个海洋传统优势产业增加值达１６５２亿元。现代渔业发展取得新突破，水产品总产量６２８．６万吨，居全国第３位；水产品出口创汇４７．８亿美元，居全国第２位。

福建省现已成立由省直３３个部门、沿海六设区市和平潭综合试验区主要领导为成员的加快海洋经济发展领导小组，从中长期看，进一步整合各涉海部门海洋管理职能的态势已很清晰。